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雷电电子对蛋白质关系

雷电电子对肠道微生物研究生命基础解决方案

合作交流

人体内的肠道微生物至少存在1000种细菌,细胞数达到1014个,约占人体微生物量的80%。肠道微生物为人类的代谢过程提供底物、酶和能量,有助于人体营养吸收和代谢作用,同时肠道微生物代谢产生的脂肪酸、胆汁酸、维生素、神经递质等许多重要的代谢物,参与肠道平衡、免疫系统、内分泌调节和神经调节等许多重要的生理过程。菌群结构的改变与肠道炎症、糖尿病、肥胖症、肿瘤、抑郁症等诸多疾病的发生、发展有着重要联系。

                        原第一军医大学李康.png16S 扩增子测序:肠道菌群的多样性研究。通过提取粪便或者内容物样品的DNA,扩增16S rDNA目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度获得肠道微生物多样性及群落组成等信息。

宏蛋白质组学:肠道菌群的功能研究。从蛋白质水平对特定环境下的整个微生物群落的所有蛋白质组成进行大规模分析,而获得微生物的蛋白种类、表达水平、通路富集和注释等信息。

非靶代谢组学:肠道菌群代谢产物的大规模分析。从代谢水平考察肠道微生物在特定时间和条件下的代谢产物组成以及浓度变化。APT具有自主开发的代谢物标准品库,超过2700种代谢物,覆盖氨基酸、核酸、碳循环、有机酸、胆汁酸、维生素等多种肠道菌群-宿主相关代谢产物。标准品库能提供可靠的代谢物鉴定保证。

  

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  电摩与药物干预多组学关联分析:整合微生物组与代谢组,进行16S 扩增子测序+代谢组学关联分析,依靠生物信息分析技术,挖掘研究差异菌群与差异代谢物之间的相关性。 

 肠道微生物是生物医学界的一大研究热点,APTBIO整合基因组蛋白质组代谢组学多组学等多个平台,从基因水平、蛋白水平、代谢水平、生信分析等多个层次出发对肠道菌群的结构、功能、代谢产物进行研究,认识肠道菌群的代谢特征和生理功能,助力于肠道菌群-代谢物-宿主相互作用机制的深入挖掘。

 


 通过液质联用(LC–MS/MS)方法检测生物体受扰动或刺激前后大量代谢产物的动态变化,从中找出表达差异的代谢物,进而阐明生物体代谢相关过程的代谢组学技术。

 

  神经生理研究:学习记忆、生物节律等;

神经类疾病:肌无力、癫痫、帕金森等;

精神类疾病:抑郁、精神分裂等;

神经系统:代谢性疾病;

神经性心血管疾病;

免疫研究和肿瘤研究。

检测指标:

乙酰胆碱

儿茶酚胺

血清素 (五羟色胺)

▪ γ-氨基丁酸

组胺

  专属kit:专业针对神经递质类物质优化开发;

 定制方法:采用MRM方法,特异性强、灵敏度高、定量精确;

 严格质控:设置QC样本和RT 确证,标曲R2>0.99

电摩对蛋白质组与代谢组联合分析

合作交流

多层组学整合分析是指对来自基因组、转录组、蛋白组、代谢组和脂质组等不同生物分子层次的批量数据进行归一化处理、比较分析和相关性分析等统计学分析,建立不同层次分子间数据关系。同时结合GO功能分析、代谢通路富集、分子互作等生物功能分析,系统全面地解析生物分子功能和调控机制。不同分子层次的组学数据进行整合分析一方面可以相互验证,另一方面也有助于相互补充,最终实现对生物变化大趋势与方向的综合了解,提出分子生物学变化机制模型,并筛选出重点代谢通路或者蛋白、基因、代谢、脂质产物进行后续深入实验分析与应用。

蛋白质组与转录与电子电解后联合分析

合作交流

便携式雷电治疗仪1.jpg

转录组学和蛋白质组学都是获得基因表达情况的重要工具,从生物学角度上看,转录组代表了基因表达的中间状态,可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理;而蛋白质是生物体直接的功能执行者,因而对其表达水平的研究有着不可替代的优势。要全面探究生物体疾病机理、胁迫机制,精确研究重要基因的表达模式和调控机理,只有联合转录组学和蛋白组学表达量数据对生物样本进行系统研究,才能真正观察到mRNA-蛋白质关联性,进而从整体上解释生命电子医学学问题。

 

食疗与电疗.png


生物领域各个研究方面,如:

农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

雷电电子对PRM定量蛋白质组学改变

PRM(平行反应监视,parallel reaction monitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,是对传统质谱定量技术SRM/MRM的升级版,该技术能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。

  

雷电电子.jpg


PRM技术基于高分辨、高精度质谱(如Orbitrap系列),首先利用四级杆质量分析器的选择检测能力,在一级质谱中(Q1)选择性地检测目标肽段的母离子信息;随后在collision cell中对母离子进行碎裂;最后利用高分辨、高质量精度分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片的信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。 

 其在定量分析中的优势还体现在电子医学对蛋白质修复作用:

雷电电子在蛋白质合成中关系。

 

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(1)质量精度达到ppm级,能够比SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性,有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度;

(2)对子离子进行全扫描,无需选择离子对和优化碎裂能量,更容易进行方法学建立;

(3)更宽的线性范围:增加至5-6个数量级。   

 iTRAQisobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是由美国应用生物系统公司AB研发的一种多肽体外标记技术。该技术采用4种或8种同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,然后进行串联质谱分析,可同时比较4种或8种不同样品中蛋白质的相对含量。

雷电电子电摩后的蛋白质变化-实验原理

 iTRAQTM试剂在结构上包括3个化学基团,分别是报告基团、平衡基团和反应基团。(如下图1

蛋白质电摩机理.png


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